新农合跨省住院报销比例如下：
- 在乡镇卫生院就医的报销比例为90%，起付线为100元。
- 在县级定点医院就医的报销比例为82%，起付线为200元。
- 在市级定点医院就医的报销比例为65%，起付线为500元。
- 在省级定点医院就医的报销比例为55%，起付线为700元。
- 在省外非定点医院就医的报销比例为45%，起付线为1000元。
请注意，这些信息可能会随着政策的更新和调整而变化，建议直接咨询当地新农合管理机构以获取最新信息
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